Itachi gioca con il piccolo Sasuke e ripensa a una delle sue missioni: si ricorda del giorno in cui, dopo aver condiviso dei dolcetti con Izumi, era stato incaricato da Nonna Gatta di trovare un gatto ninja, insieme a Shinko, Tenma e Yuuki. Tenma era personalmente coinvolto nel portare a termine la missione, poiché i baffi di quel gatto erano l'ingrediente di una medicina per il padre malato. Il gatto ninja riusciva a sfuggire ai suoi inseguitori, ma alla fine è proprio Itachi a catturarlo. Ripensando a quella missione e all'amicizia nata con il suo compagno di squadra, si rattrista, perché poco dopo Tenma era stato ucciso durante un altro incarico. Il dolore risveglia lo Sharingan di Itachi, e il piccolo Sasuke lo nota.

La Volpe a Nove Code attacca il Villaggio della Foglia e, durante lo scontro, muoiono sia la madre che il padre di Naruto. Approfittando della fase di ricostruzione, vengono ridefiniti alcuni confini del paese e il clan Uchiha, assieme al corpo di polizia, nonostante il malcontento generale, saranno costretti a trasferirsi in una zona periferica. Nel frattempo, Itachi inizia a frequentare l'Accademia, ma si rivela presto uno studente molto brillante che eccelle in tutte le materie e che è già in grado di padroneggiare tecniche proibite. Per questo motivo, gli insegnati e il corpo docenti, valutano la possibilità di farlo diplomare in anticipo rendendolo così un ninja a tutti gli effetti.

 Itachi è testimone degli orrori della guerra. Sasuke rivive anche i momenti in cui Mikoto, sua madre, ha detto a Itachi che sarebbe diventato un fratello maggiore. Il suo "fratellone" si è sempre preso cura di lui, ma una notte sente un vento minaccioso.

Sasuke accetta di tornare al Villaggio, ma rifiuta di far parte della squadra dei suoi vecchi compagni.

Boruto racconta a Sarada e Sumire cosa ha fatto Sasuke in questi tre anni, mentre Shikamaru inizia a dubitare dei suoi ricordi e inizia a sospettare che Boruto sia in realtà il legittimo figlio di Naruto. Mitsuki intercetta Boruto e lo attacco con l'intento di ucciderlo anche a costo di uccidere persino Sarada. 

Tsunade riunisce le squadre del Villaggio della Foglia per informarle che è in corso una riunione d'emergenza.

Sakura cura la ferita di Hinata e Shikamaru mentre guarda il Chibaku Tensei.

Naruto si sveglia e scopre che Sasuke è scomparso, mentre Shikamaru gli comunica che gli Anbu si sono ritirati.

Naruto e Shikamaru si dirigono alla torre per trovare Sasuke, mentre Neji cerca di fermare i membri dell'Anbu.

Deidara, in volo sul suo drago, fa esplodere un gruppo di ninja della Sabbia.

Sasuke mette fuori combattimento Izumo e Kotetsu e viene intercettato da Kakashi.

Sasuke e la sua squadra svolgono il compito assegnato dal padre: mantenere l'ordine nel villaggio.

Sasuke si rende conto che suo padre si schiera sempre con suo fratello.

Tsunade termina la lettura della prima parte del romanzo di Jiraiya, impaziente di iniziare la seconda.

Tsunade continua a leggere il racconto e rimane sorpresa quando Neji chiama l'uomo mascherato "padre".