Itachi, Sasori e Kisame vengono inviati da Pain a chiedere a Deidara di unirsi all'Organizzazione Alba. Il giorno dopo Itachi, Konan e Kakuzu vengono inviati sempre da Pain a chiedere a Hiden di unirsi all'Organizzazione Alba per essere il rimpiazzo dell'ex compagno di squadra di Kakuzu.

Juzu, un ex membro dei Sette Spadaccini della Nebbia soppravissuto all'attacco del padre di Gai, e Itachi discutono brevemente delle loro specialità prima di compiere una speciale: catturare Yagura, il Quarto Mizukage, nonché la forza portante di Isobu (Tricoda).

Mentre Naruto e Sasuke sono intrappolati all'interno dello Tsukuyomi Infinito, quest'ultimo ricorda il fratello Itachi quando egli uccide l'intero clan Uchiha ad eccezione di Sasuke.

Fugaku parla a Itachi dello Sharingan. Itachi è arrabbiato perché a suo padre non importa che Tenma Izumo sia morto.

Itachi gioca con il piccolo Sasuke e ripensa a una delle sue missioni: si ricorda del giorno in cui, dopo aver condiviso dei dolcetti con Izumi, era stato incaricato da Nonna Gatta di trovare un gatto ninja, insieme a Shinko, Tenma e Yuuki. Tenma era personalmente coinvolto nel portare a termine la missione, poiché i baffi di quel gatto erano l'ingrediente di una medicina per il padre malato. Il gatto ninja riusciva a sfuggire ai suoi inseguitori, ma alla fine è proprio Itachi a catturarlo. Ripensando a quella missione e all'amicizia nata con il suo compagno di squadra, si rattrista, perché poco dopo Tenma era stato ucciso durante un altro incarico. Il dolore risveglia lo Sharingan di Itachi, e il piccolo Sasuke lo nota.

La Volpe a Nove Code attacca il Villaggio della Foglia e, durante lo scontro, muoiono sia la madre che il padre di Naruto. Approfittando della fase di ricostruzione, vengono ridefiniti alcuni confini del paese e il clan Uchiha, assieme al corpo di polizia, nonostante il malcontento generale, saranno costretti a trasferirsi in una zona periferica. Nel frattempo, Itachi inizia a frequentare l'Accademia, ma si rivela presto uno studente molto brillante che eccelle in tutte le materie e che è già in grado di padroneggiare tecniche proibite. Per questo motivo, gli insegnati e il corpo docenti, valutano la possibilità di farlo diplomare in anticipo rendendolo così un ninja a tutti gli effetti.

 Itachi è testimone degli orrori della guerra. Sasuke rivive anche i momenti in cui Mikoto, sua madre, ha detto a Itachi che sarebbe diventato un fratello maggiore. Il suo "fratellone" si è sempre preso cura di lui, ma una notte sente un vento minaccioso.

Sasuke accetta di tornare al Villaggio, ma rifiuta di far parte della squadra dei suoi vecchi compagni.

Boruto racconta a Sarada e Sumire cosa ha fatto Sasuke in questi tre anni, mentre Shikamaru inizia a dubitare dei suoi ricordi e inizia a sospettare che Boruto sia in realtà il legittimo figlio di Naruto. Mitsuki intercetta Boruto e lo attacco con l'intento di ucciderlo anche a costo di uccidere persino Sarada. 

Tsunade riunisce le squadre del Villaggio della Foglia per informarle che è in corso una riunione d'emergenza.

Sakura cura la ferita di Hinata e Shikamaru mentre guarda il Chibaku Tensei.

Naruto si sveglia e scopre che Sasuke è scomparso, mentre Shikamaru gli comunica che gli Anbu si sono ritirati.

Naruto e Shikamaru si dirigono alla torre per trovare Sasuke, mentre Neji cerca di fermare i membri dell'Anbu.

Deidara, in volo sul suo drago, fa esplodere un gruppo di ninja della Sabbia.

Sasuke mette fuori combattimento Izumo e Kotetsu e viene intercettato da Kakashi.