Naruto SD è una mega serie gag manga disegnata dall'assistente di Kishimoto: Kenji Taira, durante la serializzazione di Naruto divisa in due serie distinte: la prima ha come protagonista Rock Lee,mentre l'altra ha invece Sasuke.

Jigen con una tecnica spazio temporale grazie al Karma si intrufola nella casa di Naruto e ordina a Kwaki di tornare da lui ma il ragazzino si rifiuta.

Boruto e Kawaki diventano "fratelli" e si allenano insieme, mentre in un pianeta sconosciuto Sasuke si ritrova in una strana e lì viene a scoprire che tanti anni fa Kaguya Otsutsuki è venuta sulla Terra insieme ad un altro misterioso membro del Clan Otsutsuki e tale personaggio sembra essere proprio Jigen e proprio quest'ultimo è intenzionato a recuperare Kawaki di persona.

Naruto sconfigge Delta,mentre Kashin Kogi rimane nell'ombra.  

Kawaki viene portato a Konoha e viene adottato da Naruto e lì inizia a diventare più sensibile.

Boruto e i suoi amici sconfiggono Ao, mentre un ragazzino di nome Kawaki uccide un altro sottoposto di Kara di nome Goro con lo stesso potere che ha Boruto.

Boruto,Sarada e Mitsuki scortano Katasuke e lo portano in un laboratorio lontano dal Vilaggio della Foglia, mentre Konohamaru e altri ninja della foglia trovano un aereo caduto in una zona sconosciuta del Paese del Fuoco e lì dentro trovano il recipiente ma vengono attaccati da uno dei pezzi grossi di Kara: Kashin Kogi che ha il compito di recuperare il recipiente.

Il Team 7 sconfiggono i Banditi Mujina, mentre il capo dei criminali viene arrestato da altri ninja di Konoha capitanati da Sai e viene sottoposto ad interrogatorio da Sasuke.

Boruto torna a Konoha con una spece  di segno maledetto ricevuto dallo spirito di Momoshiki. Qualche giorno dopo l'invasione degli Otsutsuki Boruto riceve dall'Hokage il compito di proteggere Tento, il figlio del Daiymio del Paese del Fuoco da un gruppo di criminali di nome "Banditi Mujina". Tento è anche un appassionato e collezionista di carte da gioco come Boruto e i due diventano amici.

Dopo aver completato la missione di aver protetto Tento, Boruto partecipa ad una nuova missione di rango B assieme a Sarada e Mitsuki, ma...

Mentre il Team 7 ritorna nella dimensione reale, i Kage e Obito partono per l'aldilà, mentre Madara muore a causa dell'estrazione dei Cercoteri dal suo corpo.

Zetsu Nero spiega di aver nel corso degli anni manipolato gli eventi della storia dei ninja per permettere il ritorno di Kaguya.

Mentre Gai combatte contro Madara, Naruto e Sasuke incontrano in sogno l'Eremita delle Sei Vie Hagoromo Ootsutsuki, che li identifica come reincarnazioni dei suoi due figli, Ashura e Indra.

Uscito il capitolo Boruto Special

Naruto affida a suo figlio il compito di proteggere Tento, il figlio del Daimyo.