Il Team 7, viene assegnato in una missione livello C, che consiste nello scortare un ninja di nome Shibuki, il capo del suo villaggio, a casa sua, a Takigakure. Shibuki per via delle circostanze della morte di suo padre, viene considerato un codardo dai ninja di Konoha. Eppure è molto rispettato dai bambini e dagli abitanti del villaggio. Shibuki chiede ai ninja se possono restare, ma Kakashi deve partecipare a una riunione speciale tra i jonin. I tre genin restano e sono quindi costretti ad affrontare Suien, un jonin traditore del villaggio della Cascata. Il villaggio possiede una bottiglia d'acqua segreta, chiamata "Acqua dell'Eroe" che conferisce a chiunque la beva un sostanziale, anche se temporaneo, aumento di chakra a scapito dell'accorciamento della propria vita. Il team Suien attacca il villaggio nel tentativo di rubare l'Acqua dell'Eroe, ingaggia uno scontro con il Team 7 e viene sconfitto, ma Suien si appropria dell'acqua dell'eroe e appare in vantaggio finchè Naruto non usa il potere della volpe e Sasuke attiva lo Sharingan.
Zetsu comincia il racconto attraverso i suoi ricordi mostra che Kaguya venne dal cielo e venne trovata dagli uomini del regno di So e venne portata al cospetto del loro re Tenji al quale rivelo il suo nome Kaguya venne ospitata in quel luogo diventando amica di Aino sua ancella.
Il chakra delle persone di tutto il mondo viene incanalato attraverso le radici dell'albero divino e assorbito da Madara. La puntata finisce in cui torna in vita la madre di Hagoromo Otsutsuki: KAGUYA.
Itachi, Sasori e Kisame vengono inviati da Pain a chiedere a Deidara di unirsi all'Organizzazione Alba. Il giorno dopo Itachi, Konan e Kakuzu vengono inviati sempre da Pain a chiedere a Hiden di unirsi all'Organizzazione Alba per essere il rimpiazzo dell'ex compagno di squadra di Kakuzu.
Juzu, un ex membro dei Sette Spadaccini della Nebbia soppravissuto all'attacco del padre di Gai, e Itachi discutono brevemente delle loro specialità prima di compiere una speciale: catturare Yagura, il Quarto Mizukage, nonché la forza portante di Isobu (Tricoda).
Mentre Naruto e Sasuke sono intrappolati all'interno dello Tsukuyomi Infinito, quest'ultimo ricorda il fratello Itachi quando egli uccide l'intero clan Uchiha ad eccezione di Sasuke.
Itachi gioca con il piccolo Sasuke e ripensa a una delle sue missioni: si ricorda del giorno in cui, dopo aver condiviso dei dolcetti con Izumi, era stato incaricato da Nonna Gatta di trovare un gatto ninja, insieme a Shinko, Tenma e Yuuki. Tenma era personalmente coinvolto nel portare a termine la missione, poiché i baffi di quel gatto erano l'ingrediente di una medicina per il padre malato. Il gatto ninja riusciva a sfuggire ai suoi inseguitori, ma alla fine è proprio Itachi a catturarlo. Ripensando a quella missione e all'amicizia nata con il suo compagno di squadra, si rattrista, perché poco dopo Tenma era stato ucciso durante un altro incarico. Il dolore risveglia lo Sharingan di Itachi, e il piccolo Sasuke lo nota.
La Volpe a Nove Code attacca il Villaggio della Foglia e, durante lo scontro, muoiono sia la madre che il padre di Naruto. Approfittando della fase di ricostruzione, vengono ridefiniti alcuni confini del paese e il clan Uchiha, assieme al corpo di polizia, nonostante il malcontento generale, saranno costretti a trasferirsi in una zona periferica. Nel frattempo, Itachi inizia a frequentare l'Accademia, ma si rivela presto uno studente molto brillante che eccelle in tutte le materie e che è già in grado di padroneggiare tecniche proibite. Per questo motivo, gli insegnati e il corpo docenti, valutano la possibilità di farlo diplomare in anticipo rendendolo così un ninja a tutti gli effetti.
Itachi è testimone degli orrori della guerra. Sasuke rivive anche i momenti in cui Mikoto, sua madre, ha detto a Itachi che sarebbe diventato un fratello maggiore. Il suo "fratellone" si è sempre preso cura di lui, ma una notte sente un vento minaccioso.
Boruto racconta a Sarada e Sumire cosa ha fatto Sasuke in questi tre anni, mentre Shikamaru inizia a dubitare dei suoi ricordi e inizia a sospettare che Boruto sia in realtà il legittimo figlio di Naruto. Mitsuki intercetta Boruto e lo attacco con l'intento di ucciderlo anche a costo di uccidere persino Sarada.
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Sasuke è un membro del Clan Uchiha, figlio di Fugaku e Mikoto, e fratello minore di Itachi. Fin da piccolo dimostrava grandi capacità, ma nonostante questo crebbe all'ombra di suo fratello maggiore, che era l'unico a riconoscere il suo talento. Sasuke ammirava molto Itachi.
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Minato era un ninja del Villaggio della Foglia, Quarto Hokage, marito di Kushina Uzumaki, padre di Naruto Uzumaki e il nonno paterno di Boruto e Himawari e Nonno paterno adottivo di Kawaki. E' famoso per aver inventato il Rasengan.
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Jiraiya, conosciuto anche come Eremita dei Rospi, è uno dei 3 Ninja Leggendari della Foglia, maestro di Naruto e del Quarto Hokage ed allievo di Hiruzen Sarutobi.
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Sasuke vuole realizzare la sua idea di Hokage tagliando tutti i legami con il passato. Naruto è l'ultimo ostacolo sul suo cammino e i 2 si scontrano in una battaglia.